萬昌大米的水層管理方法，水稻生育期用水量較少，因此一般實行間歇式灌溉，灌水3到5cm停灌，使水層自然風干，直到腳窩處尚有部分積水時在進行上水，可以促進好氣性微生物的活性，加速*壤速效性養分的供應；促進根系活力，達到豐收增產的功效。

  水稻采取間歇灌溉，前期多濕，后期多干，要做到灌水不積水，斷水不缺水，干濕交替，以氣養根，以根保葉，促豐產的效果。